اسقف اعظم خاچاطور کاساراتسی آموزگار و خلیفه وقت ارامنه ساکن در جلفای اصفهان بود که موسس اولین چاپخانه در خاورمیانه بود. در زمان او، کلیسای وانک یک مرکز عالی تحصیلات دین مسیحیت، فرهنگ، نگارش کتاب، نقاشی و چاپ بود. خاچاطور که علاقه زیادی به حل مشکلات و کمبودهای جامعه ارمنی ساکن جلفا در زمینه دین داشت، کتابهای زیادی در این زمینه چاپ کرد و خلیفه قدرتمندی بود تا اینکه در سن 56 سالگی به طور ناگهانی درگذشت. موزه خاچاطور کساراتسی اصفهان در کلیسای وانک قرار دارد که به پاس خدمات اسقف اعظم در زمان حیاتش، این نام به موزه اختصاص یافته است.
در موزه خاچاطور اصفهان اسناد و آثار هنری و تاریخی بسیاری از جمله نقاشیها، اشیای مربوط به کلیسا، اسناد تاریخی، کتب و نوشتههای خطی وجود دارد و همهروزه، از ساعت 8:30 صبح تا 18:30 باز و آماده بازدید است.
بخشهای مختلف موزه خاچاطور اصفهان شامل بخشهای کتابها و نسخ خطی، تابلوهای گچبری و نقاشی، آثار فلزی، دست بافتهها و رودوزیهای سنتی، ظروف چینی و سفالی به سبک ایرانی، اروپایی و چینی، آثار چوبی، بخش فرمانها شامل 170 فرمان، بخش صنعت چاپ، بخش مربوط به یپرم خان، نسلکشی ارامنه (1915) و بخش مربوط به جمهوری ارمنستان (1918 تا 1920 میلادی) است.