مسجد ذوالفقار اصفهان یکی از مساجد کوچک، اما معروف این شهر است که در محله نیماورد واقع شده که در دوران صفویه، یکی از پر رفت و آمد ترین محله های اصفهان بود. این مسجد، در دوران شاه طهماسب صفوی، در سال 950 هجری قمری، توسط شیخ محمد صفی، ساخته شد و به خاطر علاقه شدید او به امام علی(ع)، ذوالفقار نام گرفت.
کتیبه بزرگی در سردر ورودی مسجد قرار دارد که در آن، به تاریخ ساخت اشاره شده و نام شاه طهماسب و بانی مسجد، شیخ محمد صفی به خط خوش توسط محمد سیاوش، هنرمند مشهور اصفهانی، روی کاشی معرق سفیدی به رنگ لاجوردی، خطاطی شده. روی درب مسجد، به خط زیبای ثلث، اشعاری در وصف حضرت محمد(ص) و امام علی(ع) نوشته شده. بالای کتیبه سردر مسجد نیز، لوح سیاه رنگی است که در آن اشاره شده که در سال 1109 هجری قمری، در زمان سلطنت شاه عباس اول، مالیات برخی اصناف بخشیده شده بود.
گفته می شود که مسجد ذوالفقار، مدرسه و حمامی به همین نام دارد که همه، قبل از پایتخت شدن اصفهان ساخته شده است. در ضمن بناهای دیدنی و تاریخی دیگر اصفهان، حمام شیخ بهایی و حمام شاه علی نیز در نزدیکی مسجد ذوالفقار قرار دارند.